Protein–RNA interactions for Protein: Q01814

ATP2B2, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B2Q01814 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATP2B2Q01814 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B2Q01814 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B2Q01814 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms