Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MS4A2Q01362 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MS4A2Q01362 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A2Q01362 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms