Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDKL1Q00532 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDKL1Q00532 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDKL1Q00532 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms