Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HDLBPQ00341 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HDLBPQ00341 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.51■■■□□ 2
HDLBPQ00341 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
HDLBPQ00341 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HDLBPQ00341 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HDLBPQ00341 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HDLBPQ00341 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms