Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MAT1AQ00266 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAT1AQ00266 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MAT1AQ00266 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
MAT1AQ00266 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms