Protein–RNA interactions for Protein: P84077

ARF1, ADP-ribosylation factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1P84077 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF1P84077 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF1P84077 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF1P84077 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF1P84077 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF1P84077 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF1P84077 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF1P84077 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF1P84077 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF1P84077 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF1P84077 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF1P84077 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF1P84077 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF1P84077 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF1P84077 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF1P84077 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF1P84077 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF1P84077 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF1P84077 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF1P84077 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF1P84077 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF1P84077 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF1P84077 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF1P84077 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF1P84077 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF1P84077 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF1P84077 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF1P84077 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF1P84077 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF1P84077 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF1P84077 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF1P84077 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF1P84077 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF1P84077 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF1P84077 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF1P84077 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF1P84077 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF1P84077 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF1P84077 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF1P84077 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF1P84077 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF1P84077 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF1P84077 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF1P84077 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF1P84077 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF1P84077 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF1P84077 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF1P84077 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF1P84077 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF1P84077 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF1P84077 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF1P84077 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF1P84077 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF1P84077 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF1P84077 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF1P84077 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF1P84077 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF1P84077 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF1P84077 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF1P84077 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF1P84077 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF1P84077 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF1P84077 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF1P84077 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF1P84077 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF1P84077 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF1P84077 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF1P84077 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF1P84077 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF1P84077 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF1P84077 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF1P84077 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF1P84077 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF1P84077 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF1P84077 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF1P84077 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF1P84077 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF1P84077 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF1P84077 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF1P84077 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF1P84077 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF1P84077 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF1P84077 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF1P84077 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF1P84077 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF1P84077 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF1P84077 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF1P84077 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF1P84077 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF1P84077 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF1P84077 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF1P84077 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF1P84077 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF1P84077 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF1P84077 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF1P84077 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF1P84077 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF1P84077 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF1P84077 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF1P84077 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms