Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SSBP2P81877 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP2P81877 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP2P81877 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms