Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX4P78413 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX4P78413 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRX4P78413 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX4P78413 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX4P78413 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX4P78413 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX4P78413 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX4P78413 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX4P78413 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX4P78413 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX4P78413 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRX4P78413 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX4P78413 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX4P78413 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX4P78413 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX4P78413 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX4P78413 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX4P78413 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX4P78413 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX4P78413 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX4P78413 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX4P78413 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX4P78413 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX4P78413 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRX4P78413 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX4P78413 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX4P78413 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX4P78413 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX4P78413 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX4P78413 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX4P78413 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX4P78413 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX4P78413 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX4P78413 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX4P78413 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRX4P78413 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX4P78413 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX4P78413 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX4P78413 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX4P78413 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX4P78413 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX4P78413 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX4P78413 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX4P78413 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX4P78413 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX4P78413 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX4P78413 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRX4P78413 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRX4P78413 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRX4P78413 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX4P78413 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX4P78413 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX4P78413 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX4P78413 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRX4P78413 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX4P78413 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX4P78413 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX4P78413 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX4P78413 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX4P78413 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX4P78413 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX4P78413 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX4P78413 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRX4P78413 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX4P78413 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX4P78413 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX4P78413 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX4P78413 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX4P78413 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX4P78413 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX4P78413 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX4P78413 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX4P78413 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX4P78413 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX4P78413 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX4P78413 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX4P78413 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX4P78413 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX4P78413 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX4P78413 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX4P78413 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX4P78413 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX4P78413 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX4P78413 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX4P78413 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX4P78413 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX4P78413 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX4P78413 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX4P78413 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX4P78413 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX4P78413 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX4P78413 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX4P78413 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX4P78413 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX4P78413 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX4P78413 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX4P78413 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX4P78413 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX4P78413 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms