Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAE1P78406 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAE1P78406 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAE1P78406 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAE1P78406 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAE1P78406 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAE1P78406 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAE1P78406 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAE1P78406 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAE1P78406 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAE1P78406 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAE1P78406 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAE1P78406 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAE1P78406 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAE1P78406 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAE1P78406 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAE1P78406 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAE1P78406 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAE1P78406 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAE1P78406 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAE1P78406 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RAE1P78406 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAE1P78406 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAE1P78406 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAE1P78406 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAE1P78406 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAE1P78406 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAE1P78406 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAE1P78406 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAE1P78406 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAE1P78406 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAE1P78406 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAE1P78406 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAE1P78406 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAE1P78406 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAE1P78406 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAE1P78406 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAE1P78406 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAE1P78406 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAE1P78406 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAE1P78406 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAE1P78406 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAE1P78406 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAE1P78406 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAE1P78406 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAE1P78406 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAE1P78406 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAE1P78406 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAE1P78406 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAE1P78406 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAE1P78406 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAE1P78406 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAE1P78406 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAE1P78406 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAE1P78406 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAE1P78406 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAE1P78406 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAE1P78406 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAE1P78406 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAE1P78406 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAE1P78406 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAE1P78406 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAE1P78406 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAE1P78406 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAE1P78406 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAE1P78406 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAE1P78406 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAE1P78406 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAE1P78406 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAE1P78406 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAE1P78406 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAE1P78406 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAE1P78406 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAE1P78406 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RAE1P78406 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAE1P78406 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAE1P78406 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAE1P78406 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAE1P78406 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAE1P78406 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAE1P78406 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAE1P78406 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAE1P78406 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAE1P78406 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAE1P78406 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAE1P78406 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAE1P78406 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAE1P78406 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAE1P78406 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAE1P78406 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAE1P78406 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAE1P78406 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAE1P78406 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAE1P78406 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAE1P78406 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAE1P78406 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAE1P78406 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAE1P78406 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAE1P78406 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAE1P78406 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms