Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ASIC1P78348 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ASIC1P78348 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms