Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TUBB4BP68371 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TUBB4BP68371 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TUBB4BP68371 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms