Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HERVK_113P63132 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HERVK_113P63132 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 513.2 ms