Protein–RNA interactions for Protein: P63124

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P63124 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HERV-K104P63124 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERV-K104P63124 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERV-K104P63124 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERV-K104P63124 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HERV-K104P63124 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P63124 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HERV-K104P63124 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms