Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOBP62745 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOBP62745 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOBP62745 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOBP62745 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOBP62745 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOBP62745 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOBP62745 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOBP62745 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOBP62745 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOBP62745 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOBP62745 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOBP62745 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOBP62745 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RHOBP62745 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOBP62745 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOBP62745 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOBP62745 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOBP62745 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOBP62745 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOBP62745 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOBP62745 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOBP62745 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RHOBP62745 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOBP62745 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOBP62745 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOBP62745 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOBP62745 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOBP62745 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOBP62745 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOBP62745 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RHOBP62745 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RHOBP62745 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOBP62745 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOBP62745 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOBP62745 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOBP62745 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOBP62745 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOBP62745 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOBP62745 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOBP62745 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOBP62745 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOBP62745 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOBP62745 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RHOBP62745 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOBP62745 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOBP62745 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOBP62745 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOBP62745 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOBP62745 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOBP62745 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOBP62745 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOBP62745 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOBP62745 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOBP62745 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOBP62745 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOBP62745 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOBP62745 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOBP62745 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOBP62745 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOBP62745 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOBP62745 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOBP62745 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOBP62745 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOBP62745 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOBP62745 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOBP62745 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOBP62745 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOBP62745 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOBP62745 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOBP62745 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOBP62745 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOBP62745 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOBP62745 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOBP62745 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOBP62745 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOBP62745 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOBP62745 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOBP62745 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOBP62745 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOBP62745 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOBP62745 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOBP62745 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOBP62745 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOBP62745 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOBP62745 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOBP62745 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOBP62745 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOBP62745 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOBP62745 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOBP62745 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOBP62745 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOBP62745 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOBP62745 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOBP62745 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOBP62745 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOBP62745 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOBP62745 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOBP62745 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOBP62745 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms