Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
LMO4P61968 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO4P61968 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO4P61968 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO4P61968 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO4P61968 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO4P61968 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO4P61968 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO4P61968 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO4P61968 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO4P61968 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO4P61968 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
LMO4P61968 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO4P61968 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO4P61968 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO4P61968 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO4P61968 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO4P61968 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO4P61968 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO4P61968 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO4P61968 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO4P61968 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO4P61968 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO4P61968 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LMO4P61968 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO4P61968 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO4P61968 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO4P61968 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO4P61968 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO4P61968 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO4P61968 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO4P61968 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO4P61968 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO4P61968 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO4P61968 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO4P61968 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO4P61968 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LMO4P61968 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO4P61968 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO4P61968 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO4P61968 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO4P61968 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO4P61968 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO4P61968 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO4P61968 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO4P61968 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO4P61968 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO4P61968 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO4P61968 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO4P61968 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO4P61968 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO4P61968 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO4P61968 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO4P61968 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LMO4P61968 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMO4P61968 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LMO4P61968 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
LMO4P61968 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMO4P61968 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LMO4P61968 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMO4P61968 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMO4P61968 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMO4P61968 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMO4P61968 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LMO4P61968 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMO4P61968 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMO4P61968 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LMO4P61968 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO4P61968 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO4P61968 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO4P61968 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO4P61968 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO4P61968 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO4P61968 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO4P61968 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO4P61968 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO4P61968 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LMO4P61968 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMO4P61968 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMO4P61968 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
LMO4P61968 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO4P61968 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO4P61968 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO4P61968 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO4P61968 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO4P61968 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO4P61968 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO4P61968 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO4P61968 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LMO4P61968 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO4P61968 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO4P61968 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO4P61968 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO4P61968 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO4P61968 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO4P61968 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO4P61968 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO4P61968 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO4P61968 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LMO4P61968 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms