Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVK-16P61578 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVK-16P61578 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVK-16P61578 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVK-16P61578 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVK-16P61578 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVK-16P61578 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVK-16P61578 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVK-16P61578 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVK-16P61578 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ERVK-16P61578 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-16P61578 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-16P61578 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-16P61578 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ERVK-16P61578 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-16P61578 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-16P61578 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-16P61578 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ERVK-16P61578 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms