Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
UBE2MP61081 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2MP61081 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms