Protein–RNA interactions for Protein: P60673

PFN3, Profilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFN3P60673 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFN3P60673 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFN3P60673 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFN3P60673 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFN3P60673 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFN3P60673 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFN3P60673 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PFN3P60673 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFN3P60673 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFN3P60673 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFN3P60673 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFN3P60673 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFN3P60673 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFN3P60673 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PFN3P60673 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFN3P60673 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFN3P60673 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFN3P60673 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFN3P60673 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFN3P60673 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFN3P60673 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFN3P60673 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFN3P60673 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PFN3P60673 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PFN3P60673 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFN3P60673 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFN3P60673 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFN3P60673 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PFN3P60673 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PFN3P60673 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFN3P60673 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFN3P60673 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFN3P60673 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFN3P60673 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFN3P60673 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PFN3P60673 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFN3P60673 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PFN3P60673 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFN3P60673 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFN3P60673 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFN3P60673 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFN3P60673 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFN3P60673 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFN3P60673 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFN3P60673 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFN3P60673 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFN3P60673 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFN3P60673 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PFN3P60673 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFN3P60673 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFN3P60673 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFN3P60673 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PFN3P60673 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFN3P60673 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFN3P60673 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFN3P60673 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFN3P60673 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFN3P60673 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFN3P60673 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFN3P60673 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFN3P60673 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PFN3P60673 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFN3P60673 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFN3P60673 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFN3P60673 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFN3P60673 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFN3P60673 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFN3P60673 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PFN3P60673 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFN3P60673 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFN3P60673 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFN3P60673 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFN3P60673 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFN3P60673 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFN3P60673 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFN3P60673 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFN3P60673 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFN3P60673 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFN3P60673 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFN3P60673 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PFN3P60673 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFN3P60673 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFN3P60673 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFN3P60673 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFN3P60673 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PFN3P60673 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PFN3P60673 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PFN3P60673 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFN3P60673 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFN3P60673 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFN3P60673 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFN3P60673 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFN3P60673 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFN3P60673 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFN3P60673 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PFN3P60673 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFN3P60673 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFN3P60673 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFN3P60673 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PFN3P60673 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms