Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERVFC1P60507 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERVFC1P60507 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERVFC1P60507 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms