Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTENP60484 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTENP60484 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTENP60484 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTENP60484 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTENP60484 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PTENP60484 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTENP60484 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PTENP60484 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTENP60484 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTENP60484 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTENP60484 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTENP60484 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTENP60484 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTENP60484 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTENP60484 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTENP60484 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTENP60484 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTENP60484 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTENP60484 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTENP60484 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTENP60484 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTENP60484 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTENP60484 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTENP60484 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTENP60484 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTENP60484 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTENP60484 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTENP60484 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTENP60484 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTENP60484 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTENP60484 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTENP60484 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTENP60484 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTENP60484 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTENP60484 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTENP60484 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTENP60484 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTENP60484 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTENP60484 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTENP60484 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTENP60484 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTENP60484 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTENP60484 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTENP60484 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTENP60484 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTENP60484 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTENP60484 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTENP60484 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTENP60484 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTENP60484 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTENP60484 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTENP60484 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTENP60484 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTENP60484 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTENP60484 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTENP60484 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTENP60484 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTENP60484 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTENP60484 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTENP60484 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTENP60484 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTENP60484 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTENP60484 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTENP60484 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTENP60484 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTENP60484 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTENP60484 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTENP60484 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTENP60484 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTENP60484 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTENP60484 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTENP60484 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTENP60484 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTENP60484 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTENP60484 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTENP60484 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTENP60484 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTENP60484 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTENP60484 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTENP60484 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTENP60484 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTENP60484 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTENP60484 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTENP60484 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTENP60484 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTENP60484 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTENP60484 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTENP60484 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTENP60484 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTENP60484 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTENP60484 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTENP60484 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTENP60484 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTENP60484 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTENP60484 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTENP60484 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTENP60484 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTENP60484 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTENP60484 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms