Protein–RNA interactions for Protein: P59901

LILRA4, Leukocyte immunoglobulin-like receptor subfamily A member 4, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LILRA4P59901 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LILRA4P59901 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LILRA4P59901 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LILRA4P59901 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LILRA4P59901 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms