Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCDC1P59894 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCDC1P59894 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCDC1P59894 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms