Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP11P59045 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP11P59045 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP11P59045 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP11P59045 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP11P59045 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP11P59045 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP11P59045 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP11P59045 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP11P59045 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP11P59045 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP11P59045 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP11P59045 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP11P59045 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP11P59045 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP11P59045 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP11P59045 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP11P59045 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP11P59045 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP11P59045 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP11P59045 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP11P59045 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms