Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GSDMDP57764 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GSDMDP57764 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GSDMDP57764 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms