Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN8P56748 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLDN8P56748 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN8P56748 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms