Protein–RNA interactions for Protein: P56589

PEX3, Peroxisomal biogenesis factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX3P56589 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX3P56589 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX3P56589 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX3P56589 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX3P56589 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX3P56589 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX3P56589 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX3P56589 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX3P56589 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PEX3P56589 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX3P56589 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX3P56589 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX3P56589 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX3P56589 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX3P56589 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX3P56589 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX3P56589 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX3P56589 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PEX3P56589 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX3P56589 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX3P56589 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PEX3P56589 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX3P56589 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX3P56589 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX3P56589 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX3P56589 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX3P56589 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX3P56589 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX3P56589 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX3P56589 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX3P56589 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX3P56589 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX3P56589 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX3P56589 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PEX3P56589 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX3P56589 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX3P56589 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX3P56589 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX3P56589 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX3P56589 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX3P56589 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX3P56589 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PEX3P56589 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX3P56589 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX3P56589 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX3P56589 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX3P56589 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX3P56589 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX3P56589 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PEX3P56589 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX3P56589 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX3P56589 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX3P56589 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX3P56589 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PEX3P56589 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX3P56589 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX3P56589 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX3P56589 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX3P56589 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX3P56589 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX3P56589 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX3P56589 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX3P56589 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX3P56589 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PEX3P56589 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX3P56589 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX3P56589 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX3P56589 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX3P56589 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX3P56589 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX3P56589 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX3P56589 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX3P56589 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX3P56589 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PEX3P56589 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PEX3P56589 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PEX3P56589 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX3P56589 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX3P56589 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX3P56589 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX3P56589 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX3P56589 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX3P56589 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PEX3P56589 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX3P56589 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX3P56589 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX3P56589 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX3P56589 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX3P56589 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PEX3P56589 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX3P56589 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX3P56589 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX3P56589 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX3P56589 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX3P56589 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX3P56589 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX3P56589 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX3P56589 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX3P56589 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PEX3P56589 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms