Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GFRA1P56159 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GFRA1P56159 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms