Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
AFDNP55196 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
AFDNP55196 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
AFDNP55196 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
AFDNP55196 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
AFDNP55196 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
AFDNP55196 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
AFDNP55196 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
AFDNP55196 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
AFDNP55196 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
AFDNP55196 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AFDNP55196 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AFDNP55196 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
AFDNP55196 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
AFDNP55196 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
AFDNP55196 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AFDNP55196 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AFDNP55196 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AFDNP55196 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AFDNP55196 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AFDNP55196 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
AFDNP55196 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AFDNP55196 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AFDNP55196 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
AFDNP55196 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFDNP55196 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFDNP55196 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFDNP55196 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFDNP55196 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFDNP55196 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
AFDNP55196 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFDNP55196 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFDNP55196 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFDNP55196 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFDNP55196 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFDNP55196 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFDNP55196 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFDNP55196 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFDNP55196 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
AFDNP55196 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
AFDNP55196 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
AFDNP55196 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
AFDNP55196 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
AFDNP55196 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
AFDNP55196 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
AFDNP55196 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
AFDNP55196 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
AFDNP55196 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
AFDNP55196 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
AFDNP55196 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
AFDNP55196 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
AFDNP55196 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AFDNP55196 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AFDNP55196 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AFDNP55196 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AFDNP55196 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AFDNP55196 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
AFDNP55196 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
AFDNP55196 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
AFDNP55196 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
AFDNP55196 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
AFDNP55196 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
AFDNP55196 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
AFDNP55196 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
AFDNP55196 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AFDNP55196 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AFDNP55196 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AFDNP55196 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AFDNP55196 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AFDNP55196 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AFDNP55196 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AFDNP55196 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
AFDNP55196 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
AFDNP55196 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
AFDNP55196 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AFDNP55196 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AFDNP55196 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
AFDNP55196 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
AFDNP55196 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AFDNP55196 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
AFDNP55196 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
AFDNP55196 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
AFDNP55196 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
AFDNP55196 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AFDNP55196 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
AFDNP55196 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AFDNP55196 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
AFDNP55196 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AFDNP55196 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
AFDNP55196 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
AFDNP55196 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AFDNP55196 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
AFDNP55196 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
AFDNP55196 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AFDNP55196 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AFDNP55196 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
AFDNP55196 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
AFDNP55196 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
AFDNP55196 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
AFDNP55196 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms