Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATN1P54259 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATN1P54259 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATN1P54259 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATN1P54259 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATN1P54259 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATN1P54259 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATN1P54259 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATN1P54259 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATN1P54259 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATN1P54259 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATN1P54259 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATN1P54259 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATN1P54259 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATN1P54259 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATN1P54259 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATN1P54259 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATN1P54259 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATN1P54259 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATN1P54259 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATN1P54259 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATN1P54259 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATN1P54259 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATN1P54259 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATN1P54259 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATN1P54259 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATN1P54259 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATN1P54259 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATN1P54259 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATN1P54259 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATN1P54259 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATN1P54259 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATN1P54259 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATN1P54259 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATN1P54259 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATN1P54259 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATN1P54259 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATN1P54259 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATN1P54259 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATN1P54259 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATN1P54259 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATN1P54259 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATN1P54259 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATN1P54259 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATN1P54259 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATN1P54259 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATN1P54259 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATN1P54259 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATN1P54259 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATN1P54259 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ATN1P54259 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATN1P54259 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATN1P54259 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ATN1P54259 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ATN1P54259 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATN1P54259 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATN1P54259 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATN1P54259 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATN1P54259 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATN1P54259 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATN1P54259 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATN1P54259 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATN1P54259 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATN1P54259 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATN1P54259 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATN1P54259 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATN1P54259 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATN1P54259 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATN1P54259 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATN1P54259 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATN1P54259 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATN1P54259 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATN1P54259 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATN1P54259 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATN1P54259 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATN1P54259 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATN1P54259 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATN1P54259 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATN1P54259 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ATN1P54259 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATN1P54259 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATN1P54259 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATN1P54259 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATN1P54259 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATN1P54259 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATN1P54259 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATN1P54259 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATN1P54259 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATN1P54259 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATN1P54259 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATN1P54259 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATN1P54259 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATN1P54259 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATN1P54259 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATN1P54259 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ATN1P54259 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATN1P54259 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATN1P54259 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATN1P54259 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATN1P54259 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms