Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMTNP53814 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SMTNP53814 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMTNP53814 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SMTNP53814 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNP53814 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNP53814 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNP53814 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNP53814 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNP53814 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNP53814 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMTNP53814 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
SMTNP53814 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMTNP53814 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMTNP53814 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMTNP53814 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMTNP53814 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMTNP53814 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMTNP53814 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMTNP53814 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMTNP53814 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMTNP53814 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMTNP53814 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMTNP53814 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMTNP53814 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMTNP53814 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMTNP53814 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMTNP53814 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMTNP53814 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMTNP53814 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMTNP53814 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMTNP53814 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMTNP53814 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMTNP53814 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMTNP53814 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMTNP53814 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMTNP53814 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMTNP53814 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SMTNP53814 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMTNP53814 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMTNP53814 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMTNP53814 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMTNP53814 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMTNP53814 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMTNP53814 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMTNP53814 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMTNP53814 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMTNP53814 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMTNP53814 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMTNP53814 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMTNP53814 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMTNP53814 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMTNP53814 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMTNP53814 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMTNP53814 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMTNP53814 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMTNP53814 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNP53814 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNP53814 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNP53814 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNP53814 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNP53814 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNP53814 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNP53814 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNP53814 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMTNP53814 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMTNP53814 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMTNP53814 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SMTNP53814 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMTNP53814 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMTNP53814 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMTNP53814 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMTNP53814 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNP53814 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNP53814 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNP53814 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNP53814 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNP53814 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNP53814 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMTNP53814 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMTNP53814 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMTNP53814 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMTNP53814 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMTNP53814 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMTNP53814 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMTNP53814 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMTNP53814 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMTNP53814 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNP53814 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNP53814 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNP53814 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNP53814 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNP53814 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNP53814 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNP53814 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNP53814 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNP53814 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNP53814 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SMTNP53814 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMTNP53814 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms