Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A3P53794 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SLC5A3P53794 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SLC5A3P53794 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms