Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AP3M2P53677 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP3M2P53677 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
AP3M2P53677 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms