Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LIMK2P53671 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIMK2P53671 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms