Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMK1P53667 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LIMK1P53667 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LIMK1P53667 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms