Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA3P52797 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
EFNA3P52797 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
EFNA3P52797 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms