Protein–RNA interactions for Protein: P51825

AFF1, AF4/FMR2 family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF1P51825 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFF1P51825 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFF1P51825 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFF1P51825 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFF1P51825 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFF1P51825 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFF1P51825 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFF1P51825 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFF1P51825 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFF1P51825 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFF1P51825 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
AFF1P51825 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFF1P51825 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFF1P51825 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFF1P51825 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFF1P51825 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFF1P51825 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFF1P51825 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFF1P51825 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFF1P51825 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFF1P51825 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AFF1P51825 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFF1P51825 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFF1P51825 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFF1P51825 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AFF1P51825 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFF1P51825 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AFF1P51825 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFF1P51825 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
AFF1P51825 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFF1P51825 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFF1P51825 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFF1P51825 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AFF1P51825 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFF1P51825 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFF1P51825 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFF1P51825 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFF1P51825 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFF1P51825 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFF1P51825 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFF1P51825 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AFF1P51825 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFF1P51825 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFF1P51825 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFF1P51825 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFF1P51825 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
AFF1P51825 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFF1P51825 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFF1P51825 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AFF1P51825 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFF1P51825 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFF1P51825 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFF1P51825 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFF1P51825 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFF1P51825 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFF1P51825 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFF1P51825 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AFF1P51825 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
AFF1P51825 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AFF1P51825 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
AFF1P51825 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
AFF1P51825 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFF1P51825 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFF1P51825 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFF1P51825 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
AFF1P51825 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AFF1P51825 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFF1P51825 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFF1P51825 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFF1P51825 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFF1P51825 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFF1P51825 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
AFF1P51825 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFF1P51825 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFF1P51825 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFF1P51825 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AFF1P51825 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AFF1P51825 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AFF1P51825 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AFF1P51825 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AFF1P51825 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AFF1P51825 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AFF1P51825 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AFF1P51825 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AFF1P51825 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AFF1P51825 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AFF1P51825 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AFF1P51825 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AFF1P51825 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AFF1P51825 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AFF1P51825 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AFF1P51825 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AFF1P51825 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AFF1P51825 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AFF1P51825 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AFF1P51825 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AFF1P51825 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AFF1P51825 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AFF1P51825 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AFF1P51825 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms