Protein–RNA interactions for Protein: P51003

PAPOLA, Poly(A) polymerase alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLAP51003 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PAPOLAP51003 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PAPOLAP51003 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms