Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NUP153P49790 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
NUP153P49790 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NUP153P49790 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
NUP153P49790 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
NUP153P49790 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NUP153P49790 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NUP153P49790 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
NUP153P49790 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
NUP153P49790 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
NUP153P49790 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NUP153P49790 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NUP153P49790 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NUP153P49790 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
NUP153P49790 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NUP153P49790 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NUP153P49790 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
NUP153P49790 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NUP153P49790 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
NUP153P49790 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
NUP153P49790 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
NUP153P49790 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
NUP153P49790 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
NUP153P49790 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
NUP153P49790 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
NUP153P49790 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NUP153P49790 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NUP153P49790 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NUP153P49790 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NUP153P49790 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP153P49790 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP153P49790 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP153P49790 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP153P49790 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP153P49790 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP153P49790 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP153P49790 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP153P49790 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
NUP153P49790 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NUP153P49790 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
NUP153P49790 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NUP153P49790 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NUP153P49790 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NUP153P49790 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
NUP153P49790 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
NUP153P49790 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
NUP153P49790 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
NUP153P49790 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NUP153P49790 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NUP153P49790 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NUP153P49790 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
NUP153P49790 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
NUP153P49790 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
NUP153P49790 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NUP153P49790 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
NUP153P49790 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NUP153P49790 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NUP153P49790 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NUP153P49790 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NUP153P49790 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
NUP153P49790 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
NUP153P49790 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NUP153P49790 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
NUP153P49790 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC36■■■■□ 3.35
NUP153P49790 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC36■■■■□ 3.35
NUP153P49790 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
NUP153P49790 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
NUP153P49790 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
NUP153P49790 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NUP153P49790 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NUP153P49790 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NUP153P49790 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NUP153P49790 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NUP153P49790 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NUP153P49790 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
NUP153P49790 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
NUP153P49790 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
NUP153P49790 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
NUP153P49790 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NUP153P49790 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NUP153P49790 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NUP153P49790 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
NUP153P49790 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
NUP153P49790 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
NUP153P49790 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NUP153P49790 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NUP153P49790 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NUP153P49790 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NUP153P49790 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
NUP153P49790 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
NUP153P49790 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NUP153P49790 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NUP153P49790 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NUP153P49790 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NUP153P49790 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NUP153P49790 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
NUP153P49790 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC35.94■■■■□ 3.34
NUP153P49790 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NUP153P49790 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
NUP153P49790 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms