Protein–RNA interactions for Protein: P49754

VPS41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS41P49754 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VPS41P49754 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS41P49754 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS41P49754 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS41P49754 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS41P49754 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS41P49754 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS41P49754 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS41P49754 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS41P49754 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS41P49754 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS41P49754 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VPS41P49754 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS41P49754 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS41P49754 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS41P49754 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS41P49754 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS41P49754 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS41P49754 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS41P49754 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS41P49754 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS41P49754 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS41P49754 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS41P49754 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS41P49754 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS41P49754 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS41P49754 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS41P49754 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS41P49754 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS41P49754 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS41P49754 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS41P49754 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS41P49754 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS41P49754 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS41P49754 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS41P49754 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS41P49754 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS41P49754 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS41P49754 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS41P49754 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS41P49754 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS41P49754 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS41P49754 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VPS41P49754 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS41P49754 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS41P49754 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS41P49754 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS41P49754 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS41P49754 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS41P49754 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS41P49754 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS41P49754 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS41P49754 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS41P49754 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS41P49754 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS41P49754 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS41P49754 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS41P49754 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS41P49754 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS41P49754 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS41P49754 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS41P49754 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS41P49754 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS41P49754 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS41P49754 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS41P49754 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS41P49754 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS41P49754 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS41P49754 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS41P49754 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS41P49754 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS41P49754 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS41P49754 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS41P49754 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS41P49754 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS41P49754 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS41P49754 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS41P49754 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS41P49754 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS41P49754 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS41P49754 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS41P49754 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS41P49754 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS41P49754 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS41P49754 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS41P49754 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS41P49754 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS41P49754 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS41P49754 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS41P49754 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS41P49754 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS41P49754 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS41P49754 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS41P49754 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS41P49754 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS41P49754 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS41P49754 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS41P49754 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS41P49754 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS41P49754 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms