Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PRIM1P49642 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRIM1P49642 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PRIM1P49642 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRIM1P49642 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRIM1P49642 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PRIM1P49642 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PRIM1P49642 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRIM1P49642 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRIM1P49642 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRIM1P49642 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRIM1P49642 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRIM1P49642 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PRIM1P49642 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRIM1P49642 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms