Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPINT3P49223 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPINT3P49223 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms