Protein–RNA interactions for Protein: P49019

HCAR3, Hydroxycarboxylic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR3P49019 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HCAR3P49019 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HCAR3P49019 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms