Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RFX3P48380 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX3P48380 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX3P48380 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX3P48380 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX3P48380 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX3P48380 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX3P48380 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RFX3P48380 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX3P48380 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX3P48380 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX3P48380 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX3P48380 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX3P48380 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX3P48380 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX3P48380 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX3P48380 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX3P48380 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX3P48380 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX3P48380 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX3P48380 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RFX3P48380 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFX3P48380 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFX3P48380 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFX3P48380 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFX3P48380 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFX3P48380 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFX3P48380 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RFX3P48380 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RFX3P48380 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RFX3P48380 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RFX3P48380 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RFX3P48380 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX3P48380 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX3P48380 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX3P48380 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX3P48380 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX3P48380 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RFX3P48380 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX3P48380 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX3P48380 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RFX3P48380 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RFX3P48380 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX3P48380 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RFX3P48380 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX3P48380 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RFX3P48380 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RFX3P48380 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFX3P48380 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFX3P48380 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFX3P48380 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFX3P48380 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFX3P48380 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RFX3P48380 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFX3P48380 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFX3P48380 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RFX3P48380 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RFX3P48380 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RFX3P48380 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RFX3P48380 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX3P48380 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX3P48380 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RFX3P48380 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RFX3P48380 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX3P48380 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RFX3P48380 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX3P48380 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX3P48380 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX3P48380 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RFX3P48380 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RFX3P48380 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX3P48380 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX3P48380 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX3P48380 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFX3P48380 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX3P48380 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RFX3P48380 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX3P48380 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RFX3P48380 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RFX3P48380 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX3P48380 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RFX3P48380 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RFX3P48380 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RFX3P48380 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RFX3P48380 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RFX3P48380 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RFX3P48380 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RFX3P48380 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RFX3P48380 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX3P48380 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RFX3P48380 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFX3P48380 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFX3P48380 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RFX3P48380 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RFX3P48380 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RFX3P48380 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RFX3P48380 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RFX3P48380 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RFX3P48380 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RFX3P48380 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms