Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GRIA4P48058 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GRIA4P48058 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms