Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL21P46778 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL21P46778 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL21P46778 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL21P46778 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL21P46778 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL21P46778 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL21P46778 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL21P46778 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL21P46778 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL21P46778 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL21P46778 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL21P46778 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL21P46778 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL21P46778 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL21P46778 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL21P46778 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL21P46778 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL21P46778 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL21P46778 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL21P46778 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL21P46778 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL21P46778 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL21P46778 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL21P46778 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL21P46778 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL21P46778 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL21P46778 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL21P46778 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL21P46778 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL21P46778 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL21P46778 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL21P46778 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL21P46778 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL21P46778 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL21P46778 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL21P46778 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL21P46778 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL21P46778 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL21P46778 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL21P46778 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL21P46778 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL21P46778 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL21P46778 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL21P46778 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL21P46778 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL21P46778 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL21P46778 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL21P46778 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL21P46778 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL21P46778 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL21P46778 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL21P46778 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL21P46778 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL21P46778 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL21P46778 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL21P46778 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL21P46778 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL21P46778 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL21P46778 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL21P46778 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL21P46778 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL21P46778 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL21P46778 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL21P46778 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL21P46778 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL21P46778 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL21P46778 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL21P46778 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL21P46778 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL21P46778 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL21P46778 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL21P46778 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL21P46778 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL21P46778 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL21P46778 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL21P46778 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL21P46778 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL21P46778 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL21P46778 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL21P46778 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL21P46778 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL21P46778 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL21P46778 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL21P46778 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL21P46778 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL21P46778 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL21P46778 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL21P46778 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL21P46778 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPL21P46778 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPL21P46778 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
RPL21P46778 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPL21P46778 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPL21P46778 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RPL21P46778 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL21P46778 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL21P46778 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL21P46778 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPL21P46778 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms