Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQLP46063 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQLP46063 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQLP46063 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQLP46063 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQLP46063 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQLP46063 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQLP46063 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQLP46063 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQLP46063 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQLP46063 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQLP46063 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQLP46063 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RECQLP46063 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQLP46063 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQLP46063 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQLP46063 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQLP46063 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQLP46063 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQLP46063 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQLP46063 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQLP46063 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RECQLP46063 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQLP46063 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQLP46063 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQLP46063 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQLP46063 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQLP46063 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQLP46063 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQLP46063 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQLP46063 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RECQLP46063 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQLP46063 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQLP46063 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQLP46063 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQLP46063 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQLP46063 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQLP46063 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RECQLP46063 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQLP46063 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQLP46063 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQLP46063 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQLP46063 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQLP46063 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQLP46063 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RECQLP46063 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQLP46063 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQLP46063 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQLP46063 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQLP46063 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQLP46063 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQLP46063 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQLP46063 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQLP46063 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQLP46063 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQLP46063 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQLP46063 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RECQLP46063 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RECQLP46063 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RECQLP46063 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RECQLP46063 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RECQLP46063 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RECQLP46063 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RECQLP46063 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RECQLP46063 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RECQLP46063 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RECQLP46063 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RECQLP46063 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RECQLP46063 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RECQLP46063 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RECQLP46063 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RECQLP46063 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RECQLP46063 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RECQLP46063 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RECQLP46063 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RECQLP46063 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RECQLP46063 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RECQLP46063 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RECQLP46063 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RECQLP46063 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RECQLP46063 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RECQLP46063 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RECQLP46063 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RECQLP46063 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RECQLP46063 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RECQLP46063 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RECQLP46063 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RECQLP46063 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RECQLP46063 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RECQLP46063 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RECQLP46063 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RECQLP46063 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RECQLP46063 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RECQLP46063 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RECQLP46063 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RECQLP46063 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RECQLP46063 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RECQLP46063 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RECQLP46063 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RECQLP46063 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.6 ms