Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SLC26A3P40879 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC26A3P40879 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms