Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARL1P40616 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ARL1P40616 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARL1P40616 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARL1P40616 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARL1P40616 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARL1P40616 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARL1P40616 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ARL1P40616 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARL1P40616 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARL1P40616 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARL1P40616 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARL1P40616 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARL1P40616 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARL1P40616 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARL1P40616 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARL1P40616 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARL1P40616 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARL1P40616 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARL1P40616 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARL1P40616 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARL1P40616 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARL1P40616 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARL1P40616 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARL1P40616 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARL1P40616 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARL1P40616 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARL1P40616 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARL1P40616 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARL1P40616 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARL1P40616 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARL1P40616 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARL1P40616 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARL1P40616 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARL1P40616 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARL1P40616 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARL1P40616 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARL1P40616 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARL1P40616 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARL1P40616 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARL1P40616 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL1P40616 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL1P40616 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL1P40616 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL1P40616 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL1P40616 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL1P40616 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL1P40616 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARL1P40616 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL1P40616 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL1P40616 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL1P40616 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL1P40616 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL1P40616 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARL1P40616 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARL1P40616 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARL1P40616 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARL1P40616 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARL1P40616 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARL1P40616 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARL1P40616 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL1P40616 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL1P40616 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL1P40616 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL1P40616 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL1P40616 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL1P40616 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL1P40616 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL1P40616 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL1P40616 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL1P40616 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL1P40616 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL1P40616 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARL1P40616 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL1P40616 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL1P40616 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL1P40616 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL1P40616 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL1P40616 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL1P40616 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL1P40616 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL1P40616 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL1P40616 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL1P40616 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL1P40616 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL1P40616 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARL1P40616 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL1P40616 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL1P40616 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL1P40616 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL1P40616 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL1P40616 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL1P40616 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL1P40616 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL1P40616 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL1P40616 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL1P40616 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL1P40616 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL1P40616 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARL1P40616 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms