Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGHMBP2P38935 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
IGHMBP2P38935 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IGHMBP2P38935 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms