Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGP37231 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGP37231 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGP37231 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGP37231 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGP37231 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGP37231 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGP37231 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGP37231 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGP37231 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGP37231 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPARGP37231 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGP37231 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGP37231 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGP37231 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGP37231 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGP37231 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGP37231 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPARGP37231 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGP37231 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGP37231 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGP37231 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGP37231 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGP37231 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGP37231 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGP37231 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGP37231 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGP37231 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGP37231 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGP37231 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGP37231 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPARGP37231 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGP37231 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGP37231 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGP37231 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGP37231 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGP37231 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGP37231 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGP37231 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGP37231 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGP37231 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGP37231 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGP37231 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGP37231 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPARGP37231 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPARGP37231 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPARGP37231 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PPARGP37231 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARGP37231 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARGP37231 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARGP37231 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARGP37231 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARGP37231 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARGP37231 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPARGP37231 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGP37231 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGP37231 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGP37231 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGP37231 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGP37231 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGP37231 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGP37231 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGP37231 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGP37231 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGP37231 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGP37231 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGP37231 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPARGP37231 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGP37231 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGP37231 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGP37231 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGP37231 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGP37231 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGP37231 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGP37231 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPARGP37231 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARGP37231 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARGP37231 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARGP37231 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARGP37231 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARGP37231 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARGP37231 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARGP37231 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPARGP37231 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGP37231 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGP37231 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGP37231 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGP37231 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGP37231 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGP37231 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGP37231 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGP37231 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGP37231 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGP37231 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGP37231 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGP37231 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPARGP37231 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARGP37231 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARGP37231 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPARGP37231 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms